Черниговский переулок назван в честь черниговских святых Михаила и Федора.
В 1246 году князь Михаил со своим приближенным боярином Федором приехали в ставку хана Батыя. Все посетители должны были пройти очистительные обряды и поклониться идолам. Гостей принуждали монгольские жрецы и хан, но они отказалась. «Тебе, царь, кланяюсь, потому что Бог поручил тебе царствовать на этом свете. А тому, чему велишь поклониться, — не поклонюсь», — ответил Михаил.
Михаила и Федора казнили в Орде, и русская церковь причислила их к лику святых. По преданию, их мощи москвичи встречали в Замоскворечье в 1572 году. На этом месте, Черниговский пер., 3, поставили церковь в честь черниговских святых.